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网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿平台最喜欢见的妇科疾病之首。肾聚集中CaOx晶胞过达到饱和状态的堆积会使得肾小管癌细胞挫裂伤和凋亡,若想使得肾结石的养成。短链脂质酸由胃肠内活性污泥杆菌沤肥营养膳食人造纤维产生了,仅仅在部分区域胃肠防线中起影响,并且在平台技术水平上也起最为关键的影响。这之中,丁酸是最多样化的短链脂质酸,含有消除炎症和免疫系统阻止影响,本钻研探究丁酸对CaOx肾结石的影响以至于风险靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山三甲医院泌尿整形科吴忠副教授、周子健教授于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠院士、周子健博士研究生在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱怪物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了在线药理学学售后服务,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

一篇文章品牌:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 消费者工作单位:华山医疗机构 理论研究相亲对象:大鼠、HK-2人体细胞 分类新信息:照表组(Con)、型号组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱供应能力:网络上药剂学学论文检测

方法环节图

探索结局

深入分析的人员第一个打造大鼠三维模式,能够 身体生物化指数和组织化病检学染色的等深入分析科技手段发展丁酸能够 缩减CaOx三维模式大鼠肾CaOx硫化锌的行成和受伤,有效改善CaOx三维模式大鼠的细菌感染受伤和空气脱色成分的过早表述。虽然,丁酸还可减弱草酸介导的HK-2癌人体细胞受伤、空气脱色应激状态和癌人体细胞凋亡。 为探究性学习丁酸设计和靶染色体网咯,学习者从PubChem收集丁酸和丁酸酯的二维和3D设计(图1A)。能够PharmMapper统计数值显示库和Uniprot统计数值显示库解决后共建立出117个丁酸靶染色体供进一点分享。将染色体索引把手机通讯录STRING统计数值显示库,参与活动PPI网咯分享。Cytoscape列出了去重复的前20的核心区靶染色体的详尽网咯图,涵盖CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。这核心区染色体与网咯中的另外的染色体均大部分表现出必要的相应内容性,说明书这染色体几率产生出着分工协作帮助。GO和KEGG分享体现了了丁酸核心区染色体的相应内容路经和动物学工作(图1C)。核心区染色体大部分与类固醇皮质影响素回话、空气腐蚀应激影响性回话、亲水性氧细胞核对类固醇皮质影响素影响的反馈包括对含酸性物理化学类物质的反馈关以。综上所诉所诉,这核心区染色体大部分参与活动了空气腐蚀应激影响性和对亲水性氧的动物反馈时,是肾结石形成了体系中极其极为重要性的路经,这认为丁酸几率在肾结石中产生出极为重要性帮助。

图1| 丁酸型式与靶染色体网络数据解析(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进一歩宇宙探索丁酸对CaOx肾结石确实切靶什么是人类dna遗传遗传,深入深入分析工作员运用GEO动态数据统计库查询对GSE73680中营养对比与CaOx肾结石病人的什么是人类dna遗传遗传差异性实现了深入深入分析。对比组与CaOx结石病人的特殊力差异性把你想描述出来什么是人类dna遗传遗传(DEGs)检测要求为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共建立到3783个什么是人类dna遗传遗传遭受特殊发展,之中3379个(89.4%)什么是人类dna遗传遗传把你想描述出来调涨,404个(10.6%)什么是人类dna遗传遗传把你想描述出来再降(图2A)。对DEGs实现聚类算法深入分析深入分析,热图屏幕上显示了前10个被选中DEGs的二维细化聚类算法深入分析表现形式(图2B)。陆陆续续,深入深入分析工作员借助GeneCards动态数据统计库查询人为鉴别了370个或许与CaOx肾结石一些的什么是人类dna遗传遗传,排列前20位的分折什么是人类dna遗传遗传极其一些性评级如图所示2C如图所示。为了能够找到了丁酸治療CaOx肾结石的关健靶点,深入深入分析工作员将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石一些什么是人类dna遗传遗传除理得见好几个个Venn图。终于,CYP2C9被断定为丁酸影向CaOx肾结石的隐性靶点(图2D)。与此同时,深入深入分析工作员还实现了丁酸与CYP2C9的大分子对接的,CYP2C9的以下三个酪氨酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸充分用处,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在利用wifi网络药理学学分折CYP2C9是丁酸影响力CaOx肾结石的靶基因遗传后,钻研的人员还在生殖細胞调查否认了CYP2C9可变低草酸诱惑的HK-2生殖細胞的ROS含量、真菌感染磨损和凋亡。

图2| 大部分据库合力解析预计CYP2C9是丁酸效果于CaOx肾结石的靶基因遗传

科研结果显示

本科学试验最先显示丁酸在休外和休内均能抑止CaOx肾结石三维模型的空气阳极氧化应激性状态和细菌感染神经拉伤,己经用网咯药学学需求得到了丁酸影晌CaOx肾结石的存在靶点——CYP2C9,之后用血组织科学试验可确认CYP2C9在草酸盐介导的HK-2血组织ROS含量、细菌感染神经拉伤和凋亡。这样的显示表述丁酸已经用抑止CYP2C9来抑止CaOx肾结石的空气阳极氧化应激性状态,减小细菌感染神经拉伤。上述的时候中拜谱怪物制品供应了网咯药学学水平精准服务保障,除此之外拜谱怪物制品可不断提高成熟稳重成熟的人类基因组学、核膳食纤维组学、分泌组学等几组学货品及水平精准服务保障,喜爱致电的方式管理咨询! 基准医学文献:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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