
近日,扬州医科师范大学首附属医院科室医院科室王学浩院士评选项目团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋清互作组和靶向治疗精力产生检测分析服务。
英语怎么说大标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
英文版宝贝标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
业主院校:南京医科大学
调查原材料:细胞
拜谱打造服务质量:转录组测序+球蛋白互作组+靶点能源分解组
科技路线图:
实验可是
01、YBX1被司法鉴定为HCC中糖酵解的关键点基因遗传
本介绍信息采集HCC肺部淋巴淋巴肺部肿瘤范本(n=7)的单神经元RNA测序信息显示集进行介绍,出现糖酵解活性酶主耍集中在在肺部淋巴淋巴肺部肿瘤神经元中,hdWGCNA介绍识别系统出9个染色体信息模块(图1A-G)。TCGA-LIHC序列的存在模式介绍确立YBX1为单独存在模式风险控制方面(图1H)。进一大步融合IHC、WB测试和肺部淋巴淋巴肺部肿瘤进行与领近非肺部淋巴淋巴肺部肿瘤进行的室内空间转录组学信息显示集得知YBX1是肝神经元癌诊疗的不确定靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被确定好为改善HCC人体细胞糖酵解的关键性条件
02、YBX1推进HCC中的有氧糖酵解和繁殖
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶点动能细胞代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1加速HCC中的有氧糖酵解和增值
03、OGT与YBX1联系并提高网站YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋白酶互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1紧密联系并力促YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化强化其磷碱化,故而力促其核转位
进一歩测试YBX1的O-GlcNAc糖基化是不是损害其磷碱化,在OGT敲低的HCC神经元中或用OGT抑制作用剂OSMI-1整理,YBX1淀粉酶标准重要变低,YBX1磷碱化重要以减少(图4A-C)。IP进行实验屏幕上显示,在相等的Flag-YBX1底物标准下,YBX1-WT的磷碱化标准重要如果超过YBX1-T57A,取决于磷碱化的加入这样不实际上是而是较高的YBX1淀粉酶表达方式爱(图4D)。离心分离了核和质成分知道TMG整理的HCC神经元中YBX1核表达方式爱的提高(图4E-F),进一歩知道YBX1磷碱化的首要缓解细胞是AKT(图4G-I)。这一些知道提出O-GlcNAc糖基化按照有利于其磷碱化来明显增强YBX1淀粉酶维持性并有利于核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 表达重要于其进一点再次发生磷硝化作用表达并是可以有利于其核转位
05、YBX1推进PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1促使PKM2转录
06、YBX1 够增长组血清乳碱化呈现技术水平
的研究挖掘YBX1敲低更为明显调低核血清乳碱化,更是要格外重视是H3K18乳碱化(图6A-C)。糖酵解阻止剂2-DG的测试确认了糖酵解与组核血清乳碱化的进行关连,阻止糖酵解可更为明显调低H3K18la水平方向(图6D)。PKM2过抒发可逆性转YBX1敲低伴发的H3K18la下跌,以外源乳酸清理除了提高了H3K18la,还随着YBX1抒发上涨,建议存在的正在向意见反馈(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR确认,H3K18la能够生物富集于YBX1重启子进行增进其转录,该进程受O-GlcNAc糖基化国家宏观调控(图6H-J),并挖掘P300 上涨是YBX1增进H3K18乳酰凝成用的缘由(图6K-L)。
图6.YBX1减弱H3K18乳酸性反应遮盖横向
新闻稿件工作小结
在这些的研究中通讯报道了YBX1在HCC中高展示,然后与糖酵破译切涉及到。YBX1在T57处被O-GlcNAc装饰,为了动态平衡膳食纤维质并提高其展示。此种装饰还力促YBX1在T57处的磷酸性反应,力促其核易位。从而,上述操作过程促进了糖酵解涉及到遗传基因组的转录并多种多样乳酸的所产生。不仅而且,YBX1激发P300的转录,因而驱动器组膳食纤维的乳酸性反应,相当是H3K18la,H3K18乳酸性反应正面调整YBX1遗传基因组转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观隔代遗传双面馈环新机制图
拜谱个人总结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物制品为该研究提供了转录组测序,蛋白质互作组和靶向疗法精力产生组技术服务,拜谱海洋生物建立了完善成熟的转录组学、核蛋白组学、翻译专业后突显组学、细胞代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
可以参考医学文献
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.