
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱海洋生物 为其提供 TMT球蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
探讨最后
研发技术人员探究式伴随着保温耗时减少鸡肉的光洁度、持水力发电、成色、游走铁分量、ROS、脂质过被非金属氧化物、MDA、GSH和GPX4横向来评定肌群结构人体上皮细胞的铁突然死亡感觉。結果呈现,保温耗时减少后,鸡肉的光洁度在第8天和第6天不错变低;持水专业能力变低;的颜色变深,失却凹凸感,鲜橘鲜红色成为暗橘鲜红色。前者,游走铁、特异性氧和MDA的分量不错增多,人体上皮细胞凋亡率不错变高。 学习职工获取不相同冰箱时长的手臂脂肪备样的淀粉酶质,然而做SDS-PAGE分折,淀粉酶质条带在不相相同样一时期布局均且相仿(图1a)。按照淀粉酶在不相同备样中的表达出事情,分折知道相同样一组备样的中个数近乎于相同样一程度(图1b),详细说明手臂脂肪备样淀粉酶质兼有好的的组内相仿性和组间差别的性。 淀粉酶酶质组学共技术监定结论出1996种淀粉酶酶质。以B0为比组,选择B1、B2、B4和B6中的淀粉酶酶来相互影响理解讲解,共技术监定结论到375个DEPs。将火山图可视化深入分析,并利用FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两根标准规定讲解DEP。可是如下图表达方式出来1c-f表达方式出来,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分发型别技术监定结论出22、33、73和140个DEPs,各举分发型别上涨6、11、32和87个,上涨16、22、41和54个。聚类算法工艺测试了各种冷库周期脂肪安排中淀粉酶酶质的理解,可是提示脂肪淀粉酶酶理解相互影响现在永久保存日期的增高而增高(图1g)。
图1| 各个冰箱時间的身体肌肉原材料核蛋白组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 不一样速冻時间的肌群样板区别蛋清了解(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁自杀蛋清肽的PRM定量浅析浅析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 源于KEGG含有不一致性表答血清的铁突然死亡逻辑(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结ppt
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物体提供了TMT参考值核胆固醇组学技艺服务性培训,拜谱生物技巧已开发达成并树立了完整稳重的转录组学、核蛋白质组学、产生组学与两组学联合技巧车辆技艺服务性培训采集体系,欢迎致电咨询!
可以参考文章:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.